Joblot à Paris fabrique aussi bien des microscopes simples que des microscopes composés et observe lui-même des infusoires se développant sur les infusions végétales (paille, foin, poivre etc.).
C'est un contemporain et un disciple du savant hollandais Leeuwenhoek dont il démontre expérimentalement l'idée : que les microorganismes proviennent des contaminations des solutions par l'air ambiant.
Joblot est un des micrographes les plus enthousiastes de son époque qui publie, à ses frais, en 1718 le manuel de microscopie Descriptions et usages de plusieurs nouveaux microscopes.