Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- aoc:chambe [2016/06/21 14:48]
Stéphanie Cheviron [LE CONTEXTE JURIDIQUE]
+++ aoc:chambe [2017/07/05 15:37]
Stéphanie Cheviron supprimée
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-====== Base de données de consultation de médecine générale ======
+====== Base de données de consultations de médecine générale ======
-==== L’ÉQUIPE DE RECHERCHE ET SON PROJET ====
+===== L’ÉQUIPE DE RECHERCHE ET SON PROJET =====
 //Work in progress//
-=== • Porteur du projet ===
+==== • Porteur du projet ====
 **Dr Juliette Chambe**, PU-PH, chef de clinique de médecine générale. 1ère titulaire du poste au Département de médecine générale, nouveau, axé surtout sur pédagogie mais s'ouvre à la recherche, pas de structure de recherche pour le moment. Présente dans l’organigramme de l’Institut des Neurosciences Cellulaires et Intégratives (INCI UPR3212), Équipe 9: Lumière, rythmes et homéostasie du sommeil. Sa thèse porte sur l'insomnie. Juliette Chambe est en 4ème année de thèse, pause pour accouchement, puis reprise de la 5e année, aimerait pouvoir commencer à travailler sa bdd pour 2017.
-=== • Membres de l'équipe de recherche et/ou projet ===
+==== • Membres de l'équipe de recherche et/ou projet ====
   * Dr Juliette Chambe
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   * 13 internes pendant 3 semestres de novembre 2013 à avril 2015
-=== • Projet de recherche ===
+==== • Projet de recherche ====
 Il s’agit d’observer et d’enregistrer le déroulement de consultations de médecine générale. Lors du débrief, on repère les consultations qui ont mentionné des problèmes concernant le sommeil (sa qualité, son absence, etc.)
-=== • Objectifs du projet ===
+==== • Objectifs du projet ====
 L'objectif principal du projet est de recueillir des données sur l'insomnie destinées à nourrir la thèse de Juliette Chambe. Dans un second temps, il s'agit de pérenniser ce projet de recueil de données en le renouvelant chaque année en changeant le thème. La base de données ainsi créée s'enrichirait chaque année de nouvelles observations et consultations enregistrées, et pourrait servir de base de travail à d'autres doctorants et chercheurs.
-=== • Financement du projet ===
+==== • Financement du projet ====
+/
-=== • Type(s) et volume du corpus étudié ===
+==== • Type(s) et volume du corpus étudié ====
 Chaque étudiant suivait 2 ou 3 praticiens sur 8 à 10 demi-journées. En moyenne 10 consultations par demi-journée, environ 80 à 120 consultations par interne, en tout 1100 consultations répertoriées.
-==== LES DONNÉES DE LA RECHERCHE ====
+===== LES DONNÉES DE LA RECHERCHE =====
-=== • Types de données ===
+==== • Types de données ====
 Texte (fichiers Word et Excel) et audio (vérifier le format)
-=== • Méthode de recueil des données ===
+==== • Méthode de recueil des données ====
-Deux types de grilles de saisie sont utilisées : une **grille d’observation quantitative** et une **grille d’observation qualitative**. La grille d'observation quantitative reprend la grille créée pour l'étude nationale ECOGEN en y ajoutant les prescriptions. Chaque consultation est anonymisée à la source grâce à un codage :
+Deux types de grilles de saisie sont utilisées : une {{:aoc:modele_grille_obs_quanti.pdf|grille d’observation quantitative}} et une **grille d’observation qualitative**. La grille d'observation quantitative reprend la grille créée pour l'étude nationale ECOGEN en y ajoutant les prescriptions. Chaque consultation est anonymisée à la source grâce à au codage suivant :
-__ex__ : NS 16-12-1 (NS lettres représentant le médecin, pas ses initiales / 16-12 = date / 1 = 1ère consultation de la journée)
+**NS 16-12-1** où NS = lettres représentant le médecin, mais pas ses initiales / 16-12 = date / 1 = 1ère consultation de la journée)
 Ce code est repris pour coder le nom des fichiers audios.
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-=== • Métadonnées ===
+==== • Métadonnées ====
-Juliette Chambe et ses étudiants n'utilisent pas de standard de métadonnées spécifique. Cependant, la grille d'observation quantitative utilise le codage des symptômes et des procédures suivant la grille internationale ICPC 2 (international classification of primary cares), dont la version 3 va bientôt sortir (v1 1995, v2 2000).
+Juliette Chambe et ses étudiants n'utilisent pas de standard de métadonnées spécifique. Cependant, la grille d'observation quantitative utilise le codage des symptômes et des procédures suivant la grille internationale {{:aoc:icpc2_french.pdf|ICPC 2}} (international classification of primary cares), dont la version 3 va bientôt sortir (v1 1995, v2 2000).
 Base intéressante pour tags, très synthétique.
 Grille d'observation qualitative  notes
-=== • Anonymisation des données ===
+==== • Anonymisation des données ====
 La grille utilisée pour l’étude anonymise le nom du patient et du médecin. Le problème réside dans les fichiers audios.
 Utilisation d’un logiciel qui change la voix (Garage Band et surtout Final Cut utilisés par JC)
 Problème : réversible ? Anonymisation assurée ?
-L'utilisation d'un logiciel de transcription de la voix est possible, mais le nom du patient ou de membres de sa famille, du médecin sont parfois mentionnés pendant la consultation. Il faudrait corriger les transcriptions pour les expurger de tout détail permettant une identification directe.
+L'utilisation d'un logiciel de transcription de la voix est possible, mais le nom du patient, de membres de sa famille, ou du médecin sont parfois mentionnés pendant la consultation. Il faudrait corriger les transcriptions pour les expurger de tout détail permettant une identification directe.
-=== • Périodicité actuelle de la mise à jour de la base ===
+==== • Périodicité actuelle de la mise à jour de la base ====
-L'idée serait d'avoir un projet par an, avec la même méthode de recueil des données. Mais pour le moment, la "base" est close.
+Les travaux étant pour le moment interrompus, la "base" est close.
-=== • Volumétrie des données ===
+==== • Volumétrie des données ====
 __Texte__
-consultations en format Excel, 13 fichiers Word pour 13 internes, environ 150 consultations par interne (à vérifier après congé mat)
+consultations en format Excel, 13 fichiers Word pour 13 internes (environ 150 consultations par interne) (à vérifier après congé mat)
 __Enregistrements audios__
-enregistrements audios (44, 89, 10, 80) pour le moment. Certains généraux, certains juste sur l’insomnie
+enregistrements audios, certains d'ordre général, certains portent spécifiquement sur l’insomnie.
-Travaux interrompus, mais à renouveler avec d'autres thématiques, une par an. La bdd grandira
-=== • Stockage actuel des données ===
+==== • Stockage actuel des données ====
 Sauvegarde sur plusieurs disques durs externes.
-=== • Logiciels utilisés / à disposition pour créer / gérer les données de la recherche ===
+==== • Logiciels utilisés / à disposition pour créer / gérer les données de la recherche ====
 __Logiciels d'analyse qualitative__
-Nvivo (payant) et RQDA (gratuit) permettent de trier les données, analyses pour citations, mais les étudiants doivent d'abord fournir une première analyse papier avant d'utiliser les softs.
+**Nvivo** (payant) et **RQDA** (gratuit) permettent de trier les données, analyses pour citations, mais les étudiants doivent d'abord fournir une première analyse papier avant d'utiliser les logiciels.
 __Logiciels de traitement audio__
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 Garage Band et Final Cut
-==== LA RÉUTILISATION DES DONNÉES ====
+===== LA RÉUTILISATION DES DONNÉES =====
-=== • Public concerné ===
+==== • Public concerné ====
 Chercheurs, doctorants
-=== • Données concernées ===
+==== • Données concernées ====
 L'ensemble des données produites lors du projet.
-=== • Utilisation(s) possible(s) ===
+==== • Utilisation(s) possible(s) ====
 Il y a plusieurs angles possibles pour utiliser toutes ces données et elles pourraient servir de support à de nombreuses thèses.
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-==== LES DÉMARCHES EFFECTUÉES AVANT AOC ====
+===== LES DÉMARCHES EFFECTUÉES AVANT AOC =====
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-==== LE CONTEXTE JURIDIQUE ====
+===== LE CONTEXTE JURIDIQUE =====
-=== • Éthique ===
+==== • Éthique ====
-Le comité d'éthique a accepté le projet en première lecture, sachant que les enregistrements audios seraient déformés pour anonymisation.
+Le comité d'éthique a accepté le projet en première lecture, sachant que les voix sur les enregistrements audios seraient déformées pour anonymisation.
-=== • Données à caractère sensible (données privées, commerciales, médicales, etc.) ===
+==== • Données à caractère sensible (données privées, commerciales, médicales, etc.) ====
 Juliette Chambe contacte les médecins généralistes pour expliquer le projet (mais pas le sujet d'étude, pour ne pas les influencer dans leur pratique) et obtient leur accord verbal. L'accord des patients est obtenu à l'oral (ni enregistrement, ni accord écrit). L'accord verbal porte sur l'utilisation des données pour l'étude ; le patient accepte la présence de l'interne lors de la consultation médicale, l'observation écrite et l'enregistrement (optionnel).
-=== • Conventions de partenariat ===
+==== • Conventions de partenariat ====
 /
-=== • Licences (degré d'ouverture des données, restrictions éventuelles) ===
+==== • Licences (degré d'ouverture des données, restrictions éventuelles) ====
 Les données produites étant par nature sensibles, elles ne font et ne feront pas l'objet d'une exploitation en ligne. Juliette Chambe propose de placer les données sur un ordinateur hors ligne, installé dans son bureau et consultable uniquement sous sa supervision pour éviter tout risque de téléchargement des données sur support amovible.
-=== • Droit d'exploitation et de reproduction d'images, sons, vidéos, etc. ===
+==== • Droit d'exploitation et de reproduction d'images, sons, vidéos, etc. ====
+/
+===== LA DÉFINITION DES BESOINS =====
+==== • Ressources techniques (logiciels, stockage, visualisation de données, etc.) ====
+__Stockage des données__
+Les données doivent être stockées proprement et non plus sur disque dur externe. Sauvegarde sécurisée sur serveur en plus du stockage local sur un poste informatique ?
+__Création d'une base de données__
-==== LA DÉFINITION DES BESOINS ====
+Juliette Chambe a besoin, pour exploiter plus efficacement ses données, d'une base de données regroupant les deux grilles d'observation, les transcriptions des enregistrements et les enregistrements audios. Idéalement, elle souhaiterait pouvoir l'utiliser courant 2017.
+==== • Ressources humaines ====
-=== • Ressources techniques (logiciels, stockage, visualisation de données, etc.) ===
+==== • Ressources financières ====
-  * Stockage des données : stocker la bdd en propre, plus de bricolage
+===== RÉFÉRENCES ET EXEMPLES EN LIGNE =====
-  * accès à la base (DMG et thésards de l'UdS), si audios gardés, uniquement accès sur un poste local, hors ligne, pas de téléchargement
-  * 2017 (actuellement en congé maternité)
-=== • Ressources humaines ===
+__Bibliographie__
-=== • Ressources financières ===
+//Classification internationale des soins primaires//, M. Jarmoulle, Care éditions, ISBN 2-9600130-3-4
-==== RÉFÉRENCES ET EXEMPLES EN LIGNE ====
+===== DOCUMENTS A TÉLÉCHARGER / ANNEXES =====
-Bibliographie
+  * {{:aoc:icpc2_french.pdf|Grille internationale ICPC 2}}
+  * {{:aoc:modele_grille_obs_quanti.pdf|Modèle de grille d'observation quantitative}}
-Classification internationale des soins primaires, M. Jarmoulle, etc., Care éditions, ISBN 2-9600130-3-4
+==== Projet ECOGEN ====
-==== DOCUMENTS A TÉLÉCHARGER / ANNEXES ====
+  * {{:aoc:2013nicem040.pdf|Article sur le projet ECOGEN}}
+  * {{:aoc:ficheaidememoire.pdf|Fiche aide-mémoire}}
+  * {{:aoc:consentementenregistrementaudio.pdf|Fiche de consentement d'enregistrement audio}}
+  * {{:aoc:contratinvestigateurecogentransferabilite_1.pdf|Convention médecin investigateur}}
+  * {{:aoc:cnge_lyon_12_session_ecogen.pdf|Présentation d'ECOGEN}}

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